Wenn du links einen Lüfter einbauen würdest, würde wohl der Luftstrom gestört werden. Dadurch würde die Temperatur im System evtl. steigen (nicht viel).
Wenn du den PC neben dir hast und den Lüfter einbaust, würde es dich zusätzlich anblasen, je nach dem wie stark er ist. Natürlich kommts drauf an, ob er rein - oder rausbläst.
Ich hatte nämlich am Anfang auch einen Lüfter am Seitenfenster, dann musste ich aber die ganze Zeit "schnüzzä", da mir die Nase "gloffe" ist.