Mit CCCleaner ist das nicht so schwierig. Du kannst dort die Registry durchsuchen lassen und vor dem Cleanen fragt er dich ob du das ganze speichern sollst. Hier auf jedenfall JA sagen und Speichern.
Denn das lustige ist, wenn du jetzt was vermurkst hast, kannst du die gespeicherte Datei doppelklicken und alle Einträge sind wieder vorhanden. Somit hast du die Sicherheit dass auch danach noch alles läuft.
Zumindest war das bei mir bei einem Test so.
Was den Schaden angeht. Im besten Fall wenn die Registry zugemüllt ist bis zum weis ich was, holst du vielleicht eine Sekunde heraus wenn überhaupt, aber der Brieftasche schadest du sicherlich nicht, da CCCleaner GRATIS ist.